绑定机构
扫描成功 请在APP上操作
打开万方数据APP,点击右上角"扫一扫",扫描二维码即可将您登录的个人账号与机构账号绑定,绑定后您可在APP上享有机构权限,如需更换机构账号,可到个人中心解绑。
欢迎的朋友
万方知识发现服务平台
获取范围
  • 1 / 1
  (已选择0条) 清除 结果分析
找到 5 条结果
[硕士论文] 田尧
药物分析学 解放军军事医学科学院;中国人民解放军军事医学科学院 2013(学位年度)
摘要:表观遗传学作为一门新兴的遗传学分支学科近年来越来越受到科学界的关注。表观遗传学是与传统的遗传学相对应的。传统的遗传学研究基因序列发生改变时基因表达水平发生的变化,如基因突变、基因丢失等。而表观遗传学则主要研究基因序列不发生改变的情况下基因表达水平发生的变化,如DNA甲基化、RNA干扰、组织蛋白修饰等。
  DNA元件百科全书计划(ENCODE)是由美国国立人类基因组研究所(NHGRI)发起的,并由世界上多个国家参与的重大国际合作项目。ENCODE计划目前获得的大量数据以连续的形式存在于多种基因组区间内,但它们之间的相互作用关系在很大程度上仍是未知的,因此迫切需要定量评价不同类型ENCODE数据间相互作用关系的计算方法。目前主要缺少分析表观基因组数据的有效方法,缺少整合基因组与表观基因组的合理策略,并缺少研究与疾病关联作用的分析手段。
  小波变换可以对表观遗传组信号进行多尺度分解和去噪,观察不同尺度下的数据特征。应用小波变换方式处理不同尺度及分辨率的数据,即通过大“窗口”(大尺度)信号观测总体功能,而通过小“窗口”(小尺度)信号发现细小特征。形象的说,小波变换分析的结果既可以帮助我们看见森林又能见到树木。本文基于小波变换提出了一种全新的表观基因组分析方法。通过该分析方法,可以对表观基因组进行多尺度分析,并从组蛋白修饰的角度研究染色质结构与功能,解读表观图谱。
  本研究具体针对多尺度连续高密度的表观基因组数据集,应用小波相关性分析方法(WCO)研究了表观遗传基因组数据集间的相关性,并进行了可视化、定量化及确定化的统计学分析。具体研究工作是:
  (1)对小波相关性进行正式的统计学测试,验证应用WCO方法分析组蛋白修饰的数据是否恰当。
  (2)描述(各细胞系间)组蛋白修饰和(各组蛋白修饰的)细胞系间的小波相关模式,并评价与组蛋白修饰如何密切相关。
  (3)探索激活和抑制状态下修饰作用的小波相关,并识别ENCODE试点区间的二价染色质功能域。
  我们选用的原始数据是44个ENCODE试点区,包括从500kbp至2Mbp大小不等的14个区域和30个500kbp的区域。主要从四个方面进行小波相关分析。
  (1)对单一ENCODE试点区ENm004内GM06990细胞系中9个组蛋白修饰的小波相关进行了检测。我们首先在16kbp尺度下对各个组蛋白修饰对的小波相关性进行分析。然后在8kbp、32kbp和64kbp尺度下对H3K4me2和H3K4me3的小波相关分析进行研究。接着又在8kbp、32kbp和64kbp尺度下对各个组蛋白修饰对的平滑相关分布进行分析。
  (2)将初步观察扩展至其他ENCODE试点区,对其他43个ENCODE试点区也进行了相同的检测。我们首先在16kbp尺度下对GM06990细胞系中44个ENCODE试点区的H3K4me2和H3K4me3的小波相干分布进行分析。接着研究在8kbp、32kbp和64kbp尺度下44个ENCODE试点区H3K4me2和H3K4me3的小波相关分布。然在多尺度下分析GM06990细胞系中全部组蛋白修饰对的平均小波相关性。并对特定区域的F统计量的平滑分布,基因密度的F统计量的平滑分布和保守序列的F统计量的平滑分布进行了统计分析。在16kbp的尺度下,我们从小波相关曲线、多尺度平滑相关分布和信号相关分布三方面对HeLa-S3细胞系ENm004试点区中H3K4me2和H3K4me3的小波相关分析结果进行研究。并在同一尺度下对HeLa-S3细胞系中44个ENCODE试点区内组蛋白乙酰化与H3K4甲基化的小波相关分布进行数理统计。
  (3)对GM06990和HeLa-S3细胞系中组蛋白乙酰化和H3K4甲基化进行了分析。在尺度为16kbp下,我们从小波相关曲线、多尺度平滑相关分布、尺度为16kbp时信号相关分布三方面对在细胞系GM06990和HeLa-S3中H3K4me3的小波相关分析结果进行研究。并在16kbp尺度下,对GM06990和HeLa-S3中44个ENCODE试点区的组蛋白乙酰化与H3K4甲基化的小波相关分布进行了研究。
  (4)通过检测5%的显著性水平下某些ENCODE试点区,识别了H3K4me3和H3K27me3信号的共同位点,并研究了H3K4me3和H3K27me3的bivalent区域小波相关性。我们对GM06990激活态和抑制态修饰重叠区的bivalent区域进行了分析,检测了所有ENCODE试点区bivalent区域。经仔细检查发现,间隔区内的43个二价染色体域远离上游和下游基因,这说明我们所分析的这些二价染色体域很可能大量存在于人类基因组中。
  通过上述分析发现,小波相关的程度与多尺度ENCODE试点区的基因组分布模式密切相关。识别出的小波相关模式可检验那些用于解释组蛋白修饰功能的各种模型,如组蛋白编码、信号网络和电荷中和模型。这一发现可能有助于确证多种表观遗传学假说。另外,通过小波相关来分析激活和抑制状态下的修饰作用显示,上述数据分析方法适用于重新识别二价染色质功能域,广泛适用于探索不同实验数据类型间相互作用关系以及识别人类基因组功能域及功能元件。
[硕士论文] 闻一雷
动物学 河南师范大学 2009(学位年度)
摘要:鼠类种群波动与调节是生态学的重要科学问题之一,也是鼠类生态学研究中一个尚待解决的难题。由于自然界中食物分布在空间上的不均匀性、季节更替或环境剧变等原因,野生鼠类经常会在其栖息地和生活周期的一定阶段面临食物资源的缺乏而受到饥饿胁迫。限食对鼠类的营养状况、生理功能、免疫系统、内分泌代谢、繁殖状况及幼仔的数量和生理状况都具有显著的抑制作用。在本研究中,我们以长爪沙鼠和布氏田鼠在实验室繁殖群作为实验对象,以先限食后恢复饮食和先正常饮食后限食这种复合性限食设计来模拟野外不稳定的食物来源因素,在70%限食及限食后正常饲喂8周的情况下,采用适合的营养指标,测定了成年雄性长爪沙鼠的和布氏田鼠肥满度、激素、器官指数等变化,旨在探讨限食及限食恢复的经历对两种野生鼠类个体营养状况及免疫、繁殖状况的变化。 主要研究结果和结论如下: 1.对成年长爪沙鼠限食及恢复8周后,限食恢复组与限食组和对照组间体重变化均差异显著。70%限食使雄性长爪沙鼠的肥满度、血清甲状腺T4水平、胸腺指数显著低于对照组和限食恢复组而血清白蛋白含量、血清皮质醇含量和肾上腺指数显著高于对照组和限食恢复组。限食恢复组经过限食经历各项检测指标与对照组差异不显著,限食恢复组基本恢复或接近正常水平。 2.对成年布氏田鼠限食及恢复8周后,限食恢复组与限食组和对照组间体重变化均差异显著。70%限食显著降低了雄性布氏田鼠的血清皮质醇含量。限食恢复组胸腺指数明显降低与对照组之间差异显著。其余各项检测指标与对照组之间差异均不显著。 3.对比长爪沙鼠和布氏田鼠限食的结果。长爪沙鼠限食组的血清皮质醇高于对照组,而布氏田鼠限食组的血清皮质醇低于对照组。多项营养指标的检测表明长爪沙鼠对限食及限食恢复的经历表现的更敏感,限食组雄鼠的肥满度、血清总蛋白、甲状腺T4水平和肾上腺指数显著降低,皮质醇水平显著升高而布氏田鼠对于限食及限食恢复的经历表现不敏感,仅血清皮质醇的含量显著低于对照组。 综上所述,限食对长爪沙鼠和布氏田鼠的个体营养及免疫功能具有重要作用,限食恢复组的各项指标基本恢复或接近正常水平。食物缺乏可能在鼠类种群波动和调解中起着十分重要的作用。结果表明长爪沙鼠和布氏田鼠在生长过程中产生了显著的补偿效应。
[硕士论文] 罗凤娟
应用数学 西北农林科技大学 2008(学位年度)
摘要:随着现代统计学思想在遗传学领域的渗透以及计算机的普及和发展,数量性状的主基因-多基因混合遗传模型得到了广泛的研究和应用,现已完整的研究了7类混合遗传模型。但以往的研究只是对不同动植物主基因-多基因混合遗传的数量性状的主基因和多基因存在的鉴别分析,以及遗传模型识别和各种遗传效应的分析。此外,在估计环境方差时,必须借助不分离世代(亲本P1,P2和杂交后代F1代)来估计,而且对于此类性状的选择模型从未见报道,为育种生产带来一定的不便。 主基因.多基因混合遗传的数量性状,其表型值呈现多峰性,表现为多个正态分布的混合,即对应多个主基因基因型,其选择与普通数量性状的选择在模型假定以及分析上都有很大的不同。为此,在主基因-多基因混合遗传数量性状的单性状选择中,本研究采用重复观测数据的试验设计方案,利用单因素多元方差分析方法,分别估计了主基因效应方差、多基因效应方差、环境方差,遗传力等参数,根据直接遗传进展,建立了主基因-多基因混合遗传的数量性状的单性状选择模型,为育种工作者提供一种简单易行的选择方法,具体方法如下: 首先,对单个分离世代中主基因.多基因混合遗传的数量性状进行等重复的观测,由于各次观测值及其均值的频数分布均呈现多峰性,因此利用混合分布理论来计算。为减小计算误差,本研究采用均值的频数分布来计算各成分分布的数字特征,其中成分分布个数根据AIC准则,选择使AIC值达到最小的成分分布个数作为混合分布的成分分布数,分布中其它参数的确定利用EM算法来估计;其次,每个成分分布对应一种主基因基因型,根据各个成分分布的均值和方差,利用正态分布的极限误差将每个个体划分到相应的成分分布中,即相应的主基因基因型中,将每种主基因型作为单因素方差分析的一个处理水平,对其进行单因素的多元方差分析,分别计算主基因效应协方差阵、多基因效应协方差阵、环境协方差阵等参数;最后结合混合分布中各成分分布的权重即各主基因基因型的分离比例,计算主基因效应方差,多基因效应方差和环境方差,以及遗传力等参数,进而计算该数量性状的遗传进展。这样对不同群体选择时,可直接根据遗传进展大小进行选择,且选择效率有很大提高,从而为育种者提供了极大方便。 另外,本文的原理和方法具有通用性,对有一个主基因位点或一个以上主基因位点存在的主基因.多基因混合遗传的数量性状的选择也适用。
[硕士论文] 张冠鹏
遗传学 东北师范大学 2006(学位年度)
摘要:遗传学的发展史是遗传学的核心内容,更是生物科学的核心内容,是现代生物学发展最迅速、成果应用最广泛、与社会和个人生活关系最密切的领域。它揭示了人们认识、思考和解决遗传学问题的思想历程,揭示了遗传学的科学本质,揭示了遗传学知识的产生过程,呈现了科学家的科学态度、科学精神和科学世界观。遗传学发展简史的教育对于学生形成正确的科学思想,认识遗传学的形成过程,了解自然科学的本质,了解前人的探究过程等方面具有重要价值。对于培养学生的生物学素养乃至科学素养具有积极的意义,在探究性学习中将发挥重要的作用。本文通过问卷调查认为遗传学史在教学中未被重视,通过查阅大量文献,对遗传学简史进行了理论梳理,并对加强遗传学史的教育作出了具体建议。
  (已选择0条) 清除
公   告

北京万方数据股份有限公司在天猫、京东开具唯一官方授权的直营店铺:

1、天猫--万方数据教育专营店

2、京东--万方数据官方旗舰店

敬请广大用户关注、支持!查看详情

手机版

万方数据知识服务平台 扫码关注微信公众号

学术圈
实名学术社交
订阅
收藏
快速查看收藏过的文献
客服
服务
回到
顶部